Les activités industrielles entraînent des rejets qui s’introduisent dans les plans d’eau et dans l’atmosphère ou encore qui aboutissent dans des sites d’enfouissement. C’est toutefois dans l’air que les émissions sont généralement libérées. L’ammoniac, le méthanol, le dioxyde de soufre et le dioxyde d’azote sont de loin les polluants industriels atmosphériques les plus courants au Canada. Les décharges industrielles sont concentrées dans le sud de l’Ontario et du Québec, et en périphérie de grandes villes en Colombie Britannique et dans les Prairies.
Les activités industrielles génèrent des déchets qui sont rejetés dans les cours d'eau et l'atmosphère ou qui aboutissent dans des décharges. En général, les déchets subissent un certain traitement. Les déchets industriels rejetés dans l'atmosphère et dans l'eau peuvent perturber les écosystèmes. Par exemple, la présence dans l’eau de contaminants toxiques produits par des industries a été l'une des principales causes de la dégradation des Grands Lacs. Les précipitations acides occasionnées par les émissions des sources industrielles et des véhicules sont responsables de l'acidification de milliers de lacs d'Amérique du Nord. La concentration de sites industriels importants qui émettent des polluants atmosphériques comme du SO2 et du NO2 est un indicateur indirect des menaces pour les écosystèmes et les espèces. Les sites de rejets industriels sont concentrés dans le sud de l'Ontario et du Québec, sur la côte ouest à proximité de Vancouver et au voisinage des grandes villes de la Colombie-Britannique et des Prairies.